يُستخدم الحقن الأوتوماتيكي الكروماتوغرافي بشكل شائع في المختبرات التحليلية لإدخال العينات في أدوات التحليل اللوني، مثل أنظمة التحليل اللوني السائل عالي الأداء (HPLC) أو أنظمة تحليل الغازات (GC). وهو ينطوي على استخدام جهاز أخذ العينات التلقائي، وهو جهاز يقوم بأتمتة عملية حقن العينة. زيادة إنتاجية العينة، وتحسين إمكانية تكرار نتائج العينة، وتقليل المعالجة اليدوية، وبالتالي تقليل مخاطر الأخطاء والتلوث.